解放前，南通市幼儿园人数仅有134人，市区小学60所，普通中学24所。进过70年的发展，现已形成较为完备的教育体系，“教育之乡”享誉全国。新中国成立70年来，从南通走出了著名数学家杨乐等45位“两院”院士。20世纪90年代以来，南通的基础教育质量一直处于全省乃至全国领先地位，高考成绩连续多年领跑全省。全市小学、初中、高中阶段教育毛入学率均已达到100%，义务教育完成率达到100%。2018年末，全市拥有8所高等学校、206所普通中学、324所普通小学、508所幼儿园。2004年，我市成功组建了综合性南通大学。“十二五”期间5所高校升格更名。而1949年，南通市市区仅一所高等学校，在校学生数仅为796人，2018年南通普通高校在校学生数增加到106783人。